目前整个煤电运产业链仍存在太多的非市场因素：煤炭资源环节，市场尚未成为资源配置的基础性手段；电煤市场，煤价仍然实行双轨制；物流环节，很大一部分铁路运力通过计划配置；电力市场中，电价更是完全由政府控制，发电企业发电多少取决于计划而非市常因此，整个煤电产业链的市朝改革亟待循序渐进地推进。
从煤炭、铁路和电力三者的关系来看，煤炭和铁路、铁路和电力之间改革的内在逻辑不明显。
在垄断体制下，铁路市朝的推进在很大程度上取决于运力情况，如果运力紧张，市朝的结果只能导致更广泛的权利寻租，煤炭和电力的改革，铁路不一定必须同步跟进；煤炭和电力的改革具有一定内在联系，煤炭市朝改革最好是能率先或同步推动电力市朝改革，这主要考虑到煤价上涨带来的成本压力是否能够顺利转移。
就目前的煤炭和电力来看，电煤已经是半市朝了，而电力领域除了厂网分开外，其他环节的改革迟迟不前，推动电力市朝改革阻力较大。因此，两者对比来看，推动电煤价格市朝改革要比电力市朝改革容易得多。但由于煤炭和电力的改革具有一定的内在逻辑，推动电煤市朝改革的同时，需要在一定程度上推动电力改革来配合，这里的电力改革笔者认为就是煤电联动。
煤电产业链有太多的地方需要改革，可以把取消电煤价格双轨制作为煤电产业链市朝改革的突破口，同时完善煤电联动方案。由于目前铁路运力瓶颈仍然存在，可以据此鼓励煤电企业签订具有一定法律效力的中长期协议，对中长期协议优先配置铁路运力。当前取消电煤价格双轨制是推动整个煤电产业链改革的突破口，之后，随着时机慢慢成熟，逐步推进铁路、电力甚至煤炭资源领域的市朝改革。
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